Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FgbQ8K0E8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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FgbQ8K0E8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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FgbQ8K0E8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FgbQ8K0E8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FgbQ8K0E8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FgbQ8K0E8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms