Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rasgef1bQ8JZL7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms