Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sidt2Q8CIF6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sidt2Q8CIF6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms