Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam20aQ8CID3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam20aQ8CID3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms