Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rftn2Q8CHX7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rftn2Q8CHX7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rftn2Q8CHX7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms