Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SltmQ8CH25 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SltmQ8CH25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SltmQ8CH25 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms