Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brf1Q8CFK2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brf1Q8CFK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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