Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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Hpf1Q8CFE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Hpf1Q8CFE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hpf1Q8CFE2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hpf1Q8CFE2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hpf1Q8CFE2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hpf1Q8CFE2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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