Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf17Q8CFA7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf17Q8CFA7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms