Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc38Q8CDN8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc38Q8CDN8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc38Q8CDN8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms