Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Spef2Q8C9J3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Spef2Q8C9J3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 572.9 ms