Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8W7

A930004D18Rik, MCG147224, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930004D18RikQ8C8W7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A930004D18RikQ8C8W7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930004D18RikQ8C8W7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms