Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc113Q8C5T8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc113Q8C5T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms