Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Strip1Q8C079 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Strip1Q8C079 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Strip1Q8C079 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms