Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem87aQ8BXN9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem87aQ8BXN9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem87aQ8BXN9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms