Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Skor1Q8BX46 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Skor1Q8BX46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms