Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Slx1bQ8BX32 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slx1bQ8BX32 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx1bQ8BX32 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms