Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm4aQ8BW72 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm4aQ8BW72 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm4aQ8BW72 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.3 ms