Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Triml1Q8BVP1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Triml1Q8BVP1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Triml1Q8BVP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms