Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmod1Q8BVA4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmod1Q8BVA4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmod1Q8BVA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms