Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssc5dQ8BV57 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssc5dQ8BV57 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssc5dQ8BV57 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ssc5dQ8BV57 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms