Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abraxas1Q8BPZ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abraxas1Q8BPZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abraxas1Q8BPZ8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms