Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ckap4Q8BMK4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ckap4Q8BMK4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ckap4Q8BMK4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms