Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gga3Q8BMI3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gga3Q8BMI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gga3Q8BMI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms