Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gcfc2Q8BKT3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gcfc2Q8BKT3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gcfc2Q8BKT3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms