Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcal1Q8BJL0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smarcal1Q8BJL0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smarcal1Q8BJL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smarcal1Q8BJL0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smarcal1Q8BJL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms