Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
D130040H23RikQ8BII3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
D130040H23RikQ8BII3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
D130040H23RikQ8BII3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms