Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdca8Q8BHX3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdca8Q8BHX3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdca8Q8BHX3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms