Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vipas39Q8BGQ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vipas39Q8BGQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vipas39Q8BGQ1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms