Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
U2af1l4Q8BGJ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2af1l4Q8BGJ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms