Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg4bQ8BGE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atg4bQ8BGE6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms