Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG60

Txnip, Thioredoxin-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxnipQ8BG60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TxnipQ8BG60 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TxnipQ8BG60 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TxnipQ8BG60 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms