Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sptlc3Q8BG54 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sptlc3Q8BG54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sptlc3Q8BG54 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms