Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChfrQ810L3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ChfrQ810L3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChfrQ810L3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms