Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ube3cQ80U95 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ube3cQ80U95 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms