Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec16aQ80U30 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec16aQ80U30 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms