Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rusc2Q80U22 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rusc2Q80U22 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Rusc2Q80U22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rusc2Q80U22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Rusc2Q80U22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rusc2Q80U22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rusc2Q80U22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rusc2Q80U22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rusc2Q80U22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms