Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rexo1Q7TT28 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rexo1Q7TT28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rexo1Q7TT28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms