Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc2aQ7TSC1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc2aQ7TSC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms