Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf18Q7TS55 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms