Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Actn1Q7TPR4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Actn1Q7TPR4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Actn1Q7TPR4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms