Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPC1

Cdsn, Corneodesmosin, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdsnQ7TPC1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CdsnQ7TPC1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CdsnQ7TPC1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms