Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkd1l2Q7TN88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd1l2Q7TN88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms