Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Shq1Q7TMX5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Shq1Q7TMX5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shq1Q7TMX5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shq1Q7TMX5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms