Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl2Q78Y63 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms