Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Msrb2Q78J03 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msrb2Q78J03 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msrb2Q78J03 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms