Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nme8Q715T0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nme8Q715T0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nme8Q715T0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms