Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sned1Q70E20 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sned1Q70E20 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sned1Q70E20 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms