Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpv1Q704Y3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpv1Q704Y3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpv1Q704Y3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms