Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nemp1Q6ZQE4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nemp1Q6ZQE4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nemp1Q6ZQE4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms